V roku 2000 doviedol slovenskú hokejovú reprezentáciu k nečakanému striebru na majstrovstvách sveta v ruskom Petrohrade. V roku 2002 zase na MS vo švédskom Göteborgu sa so svojimi zverencami tešil z historického zlata. Ján Filc oslávi v nedeľu 19. februára jubileum 70 rokov.
Na trénerskú striedačku sa postavil v roku 1978 ako tréner mládeže v Plastike Nitra. Od roku 1981 pôsobil ako vedúci tréner tréningového strediska nitrianskej mládeže. Do Slovana sa vrátil v roku 1986, kde tri roky bol asistentom hlavného trénera. V rokoch 1989-1990 už zastával funkciu prvého trénera. Pôsobil aj na poste hlavného trénera rakúskeho Stadlau. V roku 1998 sa postavil za trénerské a manažérske kormidlo slovenskej reprezentačnej 20-tky a od júna 1999 bol trénerom reprezentačného "áčka". Následne na dve funkčné obdobia sa stal členom výkonného výboru SZĽH. K reprezentačnému "áčku" sa na krátky čas vrátil na Svetový pohár v roku 2004.
"Veľmi mi pomohol v názoroch Jaroslav Jiřík, ktorý ma trénoval v Nitre a s ktorým sme boli aj kolegovia, lebo ja som tam potom trénoval mládež. To boli ľudia v trénerskej oblasti. Priamo v športovej to bol určite najmä Vladimír Dzurilla, ktorý bol vynikajúci človek a mal som s ním príležitosť veľa komunikovať. Jednak počas rôznych akcií, výcvikových táborov a podobne, na ktorých sme sa spolu zúčastňovali. Hlavne v tom období, keď som pomaličky už poškuľoval po trénerskej dráhe," povedal Filc.
Filcove skúsenosti využila aj Medzinárodná hokejová federácia (IIHF), kde pôsobil v trénerskej komisii od roku 2003. V decembri 2004 zakladal Slovenskú úniu športu a istý čas bol jej predsedom. Kormidlo slovenského reprezentačného A-tímu opäť prevzal v roku 2008. Filc národný tím druhýkrát opustil v roku 2010.
Mladej slovenskej hokejovej generácii pôsobiacej v NHL by odkázal, aby si vždy spomenuli, že čo všetko urobili pre to, aby sa dostali tam, kde dnes sú. "Aby si uvedomili, že sú stále ešte na začiatku cesty. Najviac im pomôže, keď si budú pekne-krásne sledovať to, aby nohami zostali na zemi. Aby svoj talent, ktorý bez sporu bol príčinou, že sa dostali tam kde sú, ďalej rozvíjali takouto poctivou prácou a aj poctivým prístupom k ľuďom okolo. Či sú to spoluhráči, tréneri, protihráči. A aby aj ľudskú stránku brali ako veľmi dôležitú súčasť svojej výbavy. Pretože veľkí ľudia, veľkí športovci naozaj dokazujú, že hrajú alebo robia šport na vysokej úrovni. Ale hlavne sa vedia v prostredí správať tak, že sú príkladom pre ďalšie generácie," dodal pre TASR Filc.
Nositeľ Radu Ľudovíta Štúra II. triedy či Kríža prezidenta SR I. triedy Filc je ženatý. S manželkou Janou má dcéru Evu, bývalú reprezentantku v modernej gymnastike a syna Róberta, bývalého hokejového brankára. Ako dedko sa teší zo štyroch vnúčat.
